Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms