Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRF1P14222 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRF1P14222 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRF1P14222 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms