Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms