Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNB1P01574 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms