Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C6orf47O95873 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms