Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3AO14802 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms