Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD8O14715 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms