Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms