Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms