Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms