Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM5BQ9UGL1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms