Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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