Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms