Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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