Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD2Q9BSE4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms