Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIN3AQ96ST3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms