Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JSRP1Q96MG2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms