Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTV1Q96GA3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms