Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTTNBP2Q8WZ74 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms