Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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