Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms