Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms