Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPPQ6IPU0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms