Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms