Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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COL24A1Q17RW2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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COL24A1Q17RW2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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COL24A1Q17RW2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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COL24A1Q17RW2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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COL24A1Q17RW2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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COL24A1Q17RW2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL24A1Q17RW2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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