Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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