Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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