Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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