Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF239Q16600 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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