Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCAQ16586 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCAQ16586 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCAQ16586 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCAQ16586 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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