Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZIC1Q15915 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZIC1Q15915 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZIC1Q15915 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZIC1Q15915 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZIC1Q15915 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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