Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms