Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.157e-10■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.39□□□□□ -1.712e-87■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.081e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 524.82■■□□□ 1.561e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 224.39■■□□□ 1.491e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 519.3■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 PDE8A-213ENST00000560789 4664 ntTSL 25.72□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 PDE8A-206ENST00000557819 575 ntTSL 44.74□□□□□ -1.652e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.371e-7■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-7■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.365e-7■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.691e-23■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 20.9
PCBP2Q15366 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 34.86□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBD6-210ENST00000549623 544 ntTSL 419.8■□□□□ 0.766e-19■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 TCF25-218ENST00000566283 515 ntTSL 218.19■□□□□ 0.52e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.761e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATAT1-210ENST00000479562 691 ntTSL 513.57□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATAT1-209ENST00000471782 1527 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATAT1-207ENST00000462304 400 ntTSL 310.67□□□□□ -0.72e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATAT1-208ENST00000468713 1195 ntTSL 38.1□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 PELP1-209ENST00000573242 574 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POGZ-202ENST00000358476 6459 ntTSL 25.89□□□□□ -1.471e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-9■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-9■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.492e-9■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.632e-9■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 414.64□□□□□ -0.072e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 38.49□□□□□ -1.052e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 58.14□□□□□ -1.112e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 27.87□□□□□ -1.152e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.422e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.442e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.442e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.612e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.742e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.792e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.812e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.872e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.892e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.892e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 NEDD9-204ENST00000448183 4934 ntTSL 1 (best)7.53□□□□□ -1.23e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 SLC38A3-206ENST00000614032 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.653e-15■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 212.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 318.93■□□□□ 0.622e-11■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.272e-11■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-11■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.43e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.43e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.43e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.143e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 BRD4-204ENST00000594066 587 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-10■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-204ENST00000468921 512 ntTSL 516.83■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-207ENST00000518626 2737 ntTSL 212.63□□□□□ -0.396e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-206ENST00000494514 563 ntTSL 412.14□□□□□ -0.476e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-201ENST00000266252 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.876e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-202ENST00000326132 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.966e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 RNF185-205ENST00000471384 3093 ntTSL 37.68□□□□□ -1.186e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 513.33□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 ATP7B-213ENST00000634620 5653 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.626e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.466e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.416e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-204ENST00000465887 2118 ntTSL 215.35■□□□□ 0.056e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-219ENST00000636952 2869 ntTSL 513.19□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 20.8
PCBP2Q15366 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.416e-8■■■■□ 20.8
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 163.3 ms