Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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