Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRS1Q15050 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms