Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNIP1Q15025 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms