Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHPRHQ149N8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms