Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms