Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IHHQ14623 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IHHQ14623 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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