Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2H3Q13889 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms