Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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