Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM2Q13029 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
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