Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFX1Q12986 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFX1Q12986 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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