Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PTP4A2Q12974 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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