Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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