Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB40BQ12829 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB40BQ12829 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB40BQ12829 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB40BQ12829 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB40BQ12829 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB40BQ12829 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms