Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms