Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms