Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms