Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERCC6Q03468 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms